Mientras lo solucionen, se puede instalar el Thunar y su plugin para Rabbit con el comando:
sudo apt-get install rabbitvcs-thunar
Instalará automáticamente varias dependencias, entre ellas el Thunar.
Si alguien conoce cómo hacer que funcione con el Nautilus, se agradece.
Edit: Andrés Ricardo Torres Martínez nos avisa que la gente de RabbitVCS creó el paquete rabbitvcs-nautilus3 por lo que sólo hay que eliminar el paquete rabbitvcs-nautilus y ejecutar:
$sudo apt-get install rabbitvcs-nautilus3